由导演草川启造执导，2012年上映的《魔法少女奈叶The MOVIE 2nd A39s》，是由田村由香里,水树奈奈,植田佳奈,清水香里,真田麻美,柚木凉香,一条和矢,小林沙苗,久川绫,高桥美佳子,大原沙耶香,水桥香织,桑谷夏子,松冈由贵,阪田佳代,钉宫理惠,清水爱,佐久间红美,五十岚丽,浅野真澄,野上尤加奈,平井启二,中村知子,柿原彻也,唐娜·伯克,凯文·英格兰德,亚历桑德拉·海费林,韦恩·多斯特,青木强,松本忍,内匠靖明等主演的动画,动画片片。　　半年前的一连串遭遇，彻底改变了三年级小学生高町奈叶（田村由香里 配音）的人生，她以魔法少女的身份邂逅了可爱的小伙伴尤诺·斯克莱亚（水桥香织 饰），并通过连番激战与深锁着无数秘密和烦恼的菲特·泰斯特罗莎（水树奈奈 配音）成为莫逆好友。新学期开始，菲特以小学生的身份转入奈叶的班级，一切看似进入了平稳期。克就在某个毫无征兆的夜晚，奈叶和菲特遭到手持暗之书的维塔（真田麻美 配音）等三名违法渡行者的袭击，她们的魔导器也被破坏。 　　新的危机，新的对手，一切朝着不可预知的方向发展……